Dėl laukų miškelių ir kitų želdinių su minkštaisiais lapuočiais nykimo, vis dažniau Mažajam margajam geniui tenka klojoti po gyvenvietes, sodus, parkus ir jose tarp aukštesnėmis žolėmis (kiečiais, varnalėšomis) apaugusiuose plotuose ieškoti maisto.